DIVERSITAS GENETIK INTRA DAN INTER SPESIES SAPI BALI DARI SUMBAWA DAN SAPI ACEH BERDASARKAN ANALISIS MIKROSATELIT

Wahyu Haryati, Prasasti (2011) DIVERSITAS GENETIK INTRA DAN INTER SPESIES SAPI BALI DARI SUMBAWA DAN SAPI ACEH BERDASARKAN ANALISIS MIKROSATELIT. Masters thesis, Universitas Sebelas Maret.

[img] PDF - Published Version
Download (1603Kb)

    Abstract

    ABSTRAK Sapi-sapi yang terdapat di Indonesia mempunyai karakteristik yang berbeda-beda. Perbedaan karakteristik tersebut salah satunya disebabkan karena adanya diversitas genetik. Salah satu penanda genetik untuk mengetahui diversitas genetik adalah mikrosatelit. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui diversitas genetik intra dan inter spesies sapi Bali dari Sumbawa dan sapi Aceh berdasarkan analisis mikrosatelit. Penelitian ini menggunakan sampel darah sapi Bali dari Sumbawa dan sapi Aceh yang di ambil menggunakan metode venopuncture, masing-masing sebanyak 20 individu. DNA diekstrak dari total darah dengan menggunakan teknik Wizard Genomic Purification System. Fragmen DNA diamplifikasi dengan PCR menggunakan primer berturut-turut ETH225, TGLA227, INRA005, BM1824 dan MM12. DNA produk PCR dideteksi menggunakan teknik elektroforesis gel poliakrilamid 12% yang dilanjutkan dengan metode pewarnaan ethidium bromida. Data yang diperoleh dianalisis dengan menggunakan program POPGENE version 1.31. Hasil analisis alel-alel mikrosatelit menunjukkan bahwa jumlah alel setiap lokus pada intra maupun inter spesies sapi Bali dari Sumbawa dan sapi Aceh bervariasi antara 1 sampai 3 alel. Rata-rata nilai Shannon's Information index pada intra spesies sapi Bali dari Sumbawa adalah 0.45, intra spesies sapi Aceh 0.75, sedangkan pada inter spesies sapi Bali dari Sumbawa dan Aceh 0.75. Rata-rata nilai heterozigositas pada intra spesies sapi Bali dari Sumb awa 0.46, intra spesies sapi Aceh 0 68, sedangkan pada inter spesies sapi Bali dari Sumbawa dan Aceh 0.57. Hasil ini menunjukkan bahwa keragaman genetik pada intra spesies sapi Aceh lebih tinggi dibandingkan intra spesies sapi Bali dari Sumbawa dan inter spesies sapi Bali dari Sumbawa dan Aceh. Kata kunci : Sapi Bali dari Sumbawa, sapi Aceh, mikrosatelit, diversitas genetik ABSTRACT The cattle were found in Indonesia have different characteristics. One of the difference characteristics due to genetic diversity. One of the genetic markers to determine genetic diversity is a microsatellite. The purpose of this study was to investigate intra and inter genetic diversity of Bali cattle from Sumbawa and Aceh cattle based microsatellite analysis. This study used blood samples from Bali cattle from Sumbawa and Aceh cattle took with venopuncture methods, each of 20 individuals. Total DNA extracted from blood by using the Wizard Genomic Purification System. DNA fragment was amplified by PCR using the primers are ETH225, TGLA227, INRA005, BM1824 and MM12. DNA PCR product was detected using of 12% polyacrylamide gel electrophoresis followed by ethidium bromide staining method. Data were analyzed using the program POPGENE version 1:31. Results of analysis of microsatellite alleles indicated that the number of alleles per locus in the intra and inter species Bali cattle from Sumbawa and Aceh cattle varies between 1 to 3 alleles. The average value of Shannon's Information index on intra species Bali cattle from Sumbawa was 0,45, intra species Aceh cattle 0,75, while the inter species of Bali cattle from Sumbawa and Aceh cattle were 0,75. The average value of heterozygosity in intra species of Bali cattle from Sumbawa was 0,46, intra-species of Aceh cattle was 0,68, while the inter species of Bali cattle from Sumbawa and Aceh cattle were 0,57. These results suggest that genetic diversity intra species in Aceh cattle was higher than intra species Bali cattle from Sumbawa and inter-species Bali cattle from Sumbawa and Aceh cattle. Key words: Bali cattle from Sumbawa, Aceh cattle, microsatellite, genetic diversity

    Item Type: Thesis (Masters)
    Uncontrolled Keywords: Sapi Bali dari Sumbawa, sapi Aceh, mikrosatelit, diversitas genetik Bali cattle from Sumbawa, Aceh cattle, microsatellite, genetic diversity
    Subjects: Q Science > Q Science (General)
    Q Science > QL Zoology
    Divisions: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi
    Depositing User: Fairly Okta'mal
    Date Deposited: 17 Jul 2013 06:00
    Last Modified: 17 Jul 2013 06:00
    URI: https://eprints.uns.ac.id/id/eprint/5621

    Actions (login required)

    View Item