ISOLASI DNA DENGAN METODE OROZCO-CASTILLO DAN ANALISIS RAPD PADA SAWO (ACHRAS ZAPOTA L.)

Kamal, Ivadlil (2017) ISOLASI DNA DENGAN METODE OROZCO-CASTILLO DAN ANALISIS RAPD PADA SAWO (ACHRAS ZAPOTA L.). Other thesis, Universitas Sebelas Maret.

[img] PDF - Published Version
Download (275Kb)

    Abstract

    ABSTRAK Sawo (Achras zapota) merupakan salah satu komoditas buah yang memiliki nilai ekonomi tinggi di Indonesia dan memiliki potensi untuk berkembang menuju pasar internasional. Produksinya di Indonesia masih dibawah 5% dari total produksi buah di Indonesia. Analisis genetik dengan metode RAPD dilakukan untuk mengetahui keragaman genetik sawo guna menciptakan varietas unggul. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui primer yang memunculkan pita, tingkat polimorfisme dan ukuran pita DNA berdasarkan marka RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Penelitian ini dilaksanakan dengan mengamati pita DNA sawo yang dihasilkan dari amplifikasi PCR dengan metode RAPD. Sampel terdiri dari dua aksesi yaitu aksesi Manyaran dan aksesi Bojonegoro. Isolasi DNA menggunakan metode isolasi Orozco-castillo yang telah dimodifikasi. Hasil isolasi DNA sawo kemudian dianalisis berdasarkan metode RAPD menggunakan 5 primer acak yaitu OPC-5, OPC-8, OPC-13, OPD-5, OPB-2, OPB-5, OPH-18 dan OPD-11. Hasil amplifikasi DNA sawo diamati dengan menggunakan elektroforesis. Pita DNA yang terlihat kemudian dibandingkan dengan DNA marker yang memiliki fungsi untuk mengukur besarnya pita DNA dalam satuan basepair (bp) pada amplifikasi DNA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa amplifikasi DNA menggunakan OPC 5, OPC-8, OPC-13, OPD-5 dan OPD-11 menghasilkan jumlah total pita DNA sebanyak 56 pita yang memiliki ukuran kisaran 180-2000 bp. Presentasi pita DNA polimorfik yang paling tinggi yaitu sebesar 75% diperoleh dari hasil amplifikasi primer OPC-13 dan OPD-5, sedangkan presentasi pita DNA polimorfik yang paling rendah yaitu 25% diperoleh dari hasil amplifikasi primer OPD-11.

    Item Type: Thesis (Other)
    Subjects: S Agriculture > S Agriculture (General)
    S Agriculture > SB Plant culture
    Divisions: Fakultas Pertanian
    Fakultas Pertanian > Agroteknologi
    Depositing User: Rea Aisha Champa
    Date Deposited: 30 Dec 2017 22:38
    Last Modified: 30 Dec 2017 22:38
    URI: https://eprints.uns.ac.id/id/eprint/38596

    Actions (login required)

    View Item