Variability analysis of Sukun durian plant (Durio zibethinus) based on RAPD marker

Ruwaida, Ismi Puji and Supriyadi, and Parjanto, (2009) Variability analysis of Sukun durian plant (Durio zibethinus) based on RAPD marker. Bioscience, 1 (2). pp. 84-91. ISSN 2087-3940 (print), 2087-3956 (electronic)

[img] PDF - Published Version
Download (275Kb)

    Abstract

    Abstrak. Ruwaida IP, Supriyadi, Parjanto. 2009. Analisis keragaman tanaman Sukun durian (Durio zibethinus) berdasarkan penanda RAPD. Nusantara Bioscience 1: 84-91. Tujuan penelitian adalah mengkaji keragaman durian varietas sukun durian, sunan, kani, monthong, dan petruk serta keragaman durian sukun yang ditanam pada wilayah yang berbeda berdasarkan penanda RAPD. Bahan penelitian berupa daun tanaman durian varietas Sukun, Sunan, Kani, Monthong dan Petruk dari Kebun Benih Ranukutri Karanganyar; serta durian varietas Sukun dari Gempolan Karanganyar, Jepara dan Salatiga. Selanjutnya dilakakukan analisis DNA terhadap sampel daun yang diawali dengan isolasi DNA, uji kuantitas dan kualitas DNA, seleksi primer, dan amplifikasi dengan PCR. Visualisasi hasil PCR dilakukan dengan elektroforesis menggunakan EtBr yang menghasilkan pita DNA. Pita DNA selanjutnya dianalisis dengan program NTSYS untuk mendapatkan keragaman durian antar varietas dan antar durian sukun dari wilayah yang berbeda. Primer yang digunakan adalah 6 primer polimorfik, yaitu OPA-01, OPA-02, OPA-07, OPA-16, OPA-18 dan OPA-19. Pola pita DNA hasil amplifikasi menunjukkan adanya keragaman antar varietas durian Sukun, Sunan, Kani, Monthong dan Petruk serta menunjukkan keragaman durian sukun yang ditanam di wilayah yang berbeda. Dendrogram pengelompokkan menunjukkan lima varietas durian cenderung memisah, yaitu Sukun, Sunan, Monthong dan Petruk merupakan satu kelompok yang memisah dengan durian Kani. Dendrogram pengelompokkan durian Sukun yang ditanam pada wilayah berbeda menghasilkan dua kelompok, yaitu kelompok durian Sukun dari Gempolan Karanganyar dan Salatiga serta kelompok lainnya dari Kebun Benih Ranukutri Karanganyar dan Jepara. Kata kunci: analisis keragaman, DNA, Durio zibethinus, RAPD.

    Item Type: Article
    Subjects: Q Science > QH Natural history > QH301 Biology
    S Agriculture > S Agriculture (General)
    Divisions: Fakultas Pertanian > Agribisnis
    Pasca Sarjana > Magister > Agronomi
    Depositing User: Miftahful Purnanda Puspasari
    Date Deposited: 09 Jul 2013 06:17
    Last Modified: 09 Jul 2013 06:17
    URI: https://eprints.uns.ac.id/id/eprint/1462

    Actions (login required)

    View Item